Ciliophora of trilhaardiertjes zijn eencelligen waarbij in ten minste één stadium van de levenskringloop trilharen, ciliën voorkomen.
- Stam: Ciliophora
- Klasse: Karyorelictea
- Klasse: Heterotrichea (e.g. Stentor)
- Klasse: Spirotrichea
- Subklasse: Choreotrichia (e.g. Tintinnidium)
- Subklasse: Oligotrichia (e.g. Halteria)
- Subklasse: Stichotrichia (e.g. Stylonychia)
- Subklasse: Hypotrichia (e.g. Euplotes)
- Klasse: Litostomatea
- Subklasse: Haptoria (e.g .Didinium)
- Subklasse: Trichostomatia (e.g. Balantidium)
- Klasse: Phyllopharyngea
- Subklasse: Phyllopharyngia
- Subklasse: Rhynchodia
- Subklasse: Chonotrichia
- Subklasse: Suctoria (e.g. Podophrya)
- Klasse: Nassophorea
- Klasse: Colpodea (e.g. Colpoda)
- Klasse: Prostomatea (e.g. Coleps)
- Klasse: Oligohymenophorea
- Subklasse: Peniculia (e.g. Paramecium)
- Subklasse: Hymenostomatia (e.g. Tetrahymena)
- Subklasse: Scuticociliatia
- Subklasse: Peritrichia (e.g. Vorticella)
- Subklasse: Astromatia
- Subklasse: Apostomatia
- Klasse: Plagiopylea
