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En génétique, l'hérédité non-mendélienne désigne la transmission héréditaire d'un trait d'un organisme à sa descendance sans altération de la séquence génétique des chromosomes. On emploie ce terme par opposition à l'hérédité mendélienne qui est la forme la plus classique de transmission génétique dont les lois ont notamment été découvertes par Gregor Mendel au XIXe siècle. La transmission non-mendélienne repose sur des mécanismes cellulaires découverts beaucoup plus récemment qui impliquent, en particulier, les organites du cytoplasme, telles mitochondries.
L'hérédité mendélienne est impliquée dans différentes pathologies comme les maladies mitochondriales.