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La dénitrification est un phénomène biochimique qui s'opère en profondeur dans le sol, sous l'action de bactéries spécifiques, satisfaisant leur besoin en oxygène en sol hypoxique ou anoxique, par une désoxygénation des ions nitrates.
En effet, le dioxygène O2 se diffuse de moins en moins au fur et à mesure que l'on descend dans les couches inférieures du sol et ce phénomène est d'autant plus accentué que le sol est gorgé d'eau (cas d'un sol hydromorphique par exemple). Il faut savoir aussi qu'il ya 21 % de dioxygène dans notre atmosphère et 8 mg pour 1 kg d'eau.Par conséquent, les bactéries qui se trouvent dans ces types de sols manquent donc de dioxygène, nécessaire à leur survie, à leur développement et à la respiration cellulaire, notamment quand l'eau a comblé tous les espaces lacunaires du sol contenant auparavant de l'air.
C'est alors que des bactéries du type pseudomonas opèrent la dénitrification. Elles vont puiser dans les molécules de nitrates l'oxygène sous forme atomique dont elles ont besoin. Elles vont ainsi oxyder l'ion nitrate NO3-, facilement soluble dans la solution du sol grâce aux liaisons hydrogènes qu'il établit avec les molécules d'eau et facilement absorbable par les végétaux; en ion nitrite NO2, puis en monoxyde d'azote NO, après en N2O et enfin en diazote N2, exempt d'oxygène et naturellement présent dans notre atmosphère et qui va s'échapper ensuite du sol par volatilisation, pour rejoindre cette dernière. Il arrive que les bactéries n'aillent pas jusqu'à la phase ultime de cette réaction, si le taux de dioxygène est en partie suffisant pour satisfaire leur besoin.
Cette réaction est très importante en écologie et en agriculture, dans le cadre d'une lutte naturelle contre la pollution par les nitrates de la nappe phréatique, ainsi que dans le domaine du traitement des eaux usées.
- Sources : Cours d'agronomie de terminale agricole S.T.A.E. (Sciences et technologies de l'agronomie et de l'environnement, option technologies des systèmes de production).
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