Als Naturstoffchemie wird jener Zweig der Chemie bezeichnet, der sich mit der chemischen Bearbeitung von Naturstoffen beschäftigt, um bestimmte Eigenschaften zu verändern (z. B. Haltbarkeit, Farbe etc.); ein typisches Anwendungsbeispiel ist die Lederchemie. Die Forschung in diesem Bereich widmet sich außerdem der Strukturaufklärung von Naturstoffen, wie z. B. den Terpenen.
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